Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-HP01893 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms