Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SKAP2O75563 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms