Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIN3BO75182 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SIN3BO75182 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms