Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDM4AO75164 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KDM4AO75164 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms