Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPHP4O75161 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms