Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP9BO43861 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms