Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1GO43497 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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