Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COCHO43405 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COCHO43405 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COCHO43405 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COCHO43405 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms