Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYNJ2O15056 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms