Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HHLA1C9JL84 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HHLA1C9JL84 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms