Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF879B4DU55 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms