Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms