Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB13A6NJU9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms