Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms