Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms