Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C5orf49A4QMS7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms