Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHBDD3Q9Y3P4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms