Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms