Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUDCQ9Y266 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUDCQ9Y266 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms