Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNF6Q9Y252 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms