Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms