Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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