Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD1BQ9UPS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms