Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF608Q9ULD9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF608Q9ULD9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms