Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FBXO4Q9UKT5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXO4Q9UKT5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms