Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA1Q9UJY5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms