Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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