Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
REREQ9P2R6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REREQ9P2R6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms