Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC180Q9P1Z9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms