Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms