Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOMER3Q9NSC5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms