Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SALL1Q9NSC2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL1Q9NSC2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms