Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS2Q9NRF8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms