Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGB3Q9NQW8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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