Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEMA4BQ9NPR2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms