Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms