Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEBOXQ9HB31 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms