Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRCIN1Q9C0H9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms