Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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FOXQ1Q9C009 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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