Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDAC8Q9BY41 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDAC8Q9BY41 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms