Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms