Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms