Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM43Q9BTV4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms