Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCMBPQ9BTE3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms