Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK3Q9BQ16 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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