Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX18Q96RF0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX18Q96RF0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms