Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms