Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC7Q96M83 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC7Q96M83 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms