Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EP400Q96L91 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms