Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PKNOX2Q96KN3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms